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采购公告
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单一来源采购分子模拟软件LIGANDSCOUT公示

发布时间:2018-04-18 作者: 浏览次数:

一、项目名称

分子模拟软件LIGANSCOUT购置

二、拟采购货物说明

从蛋白-配体复合物结构识别药效团或者从几个已知活性的化合物出发训练药效团、并用药效团进行虚拟筛选、靶标预测是重要的药物发现技术。最新的药效团技术可以而从分子动力学模拟轨迹提取快照的药效团、模拟相互作用的动态变化并进行虚拟筛选可以极大的提高基于药效团虚拟筛选的性能;将同一个靶标、不同结合模式的药效团合并进行虚拟筛选,以提高药效团虚拟筛选的精度也是目前药效团虚拟筛选技术的一个亮点,实现Ensemble药效团虚拟筛选。

Ligandscout药物设计软件可以全面解决上述问题,1)支持基于结构的药效团生成;2)支持基于配体的药效团识别;3)支持构象搜索、结构准备;4)Ligandscout支持分子多种格式动力学模拟轨迹的读入、生成药效团,并可以进行药效团的叠合与比较,是目前唯一一款支持此类功能的软件;5)支持布林运算,在虚拟筛选中使用and、not、or对药效团进行组合运算实现多目标虚拟筛选,目前没有其它药效团技术件可以支持此类运算;6)布林运算也可以用于ensemble虚拟筛选,将同一个蛋白的不同药效团用or组合,只要命中其中一个蛋白即视为命中;7)除此之外,还支持数据库挖掘:从CHEMBL等数据库按靶标提取化合物、进行分析、用于药效团训练与验证;8)共价药效团元素(Feature)的识别;9)支持配体-金属相互作用药效团元素与虚拟筛选,Ligandscout支持金属Mg,Mn,Zn,Fe等常见金属并考虑相互作用的空间取向,是同类技术中最全面的产品;10)虚拟筛选支持部分药效团元素匹配;11)包含分子对接计算功能实现指定结合位点对接、blind docking;12)包含结合位点预测;13)包含多种蛋白-配体相互作用打分函数,用于docking结果的后处理;14)结合位点的优化;15)支持方法学验证;16)同时支持命令行、图形界面与KNIME界面;17)Ligandscout提供作用谱分析功能,将自己工作中验证的靶标累积起来,用来预测化合物的可能靶标、毒性或脱靶效应。

广州市墨灵格信息科技有限公司是Ligandscout软件在中国的独家总代理商,并负责该软件在中国地区的销售、技术服务、培训等工作,根据用户需要进行灵活、及时的跟踪服务。

三、单一来源采购供应商名称

广州市墨灵格信息科技有限公司

四、公示的期限

公示时间:2018年4月18日至4月24日

有关单位和个人如对公示内容有异议,请在公示期内以书面形式反馈至采购与招投标管理办公室。

联系人:杨老师 电话:027-87281981

电子邮箱:hncgzb@mail.hzau.edu.cn

联系地址:湖北省武汉市洪山区狮子山街1号华中农业大学采购与招投标管理办公室


单一来源论证