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华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发

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日产能高达6TB，全天候提供高质量数据；4联芯片平台（有效READS数/芯片可5000M），支持PE150和PE100不同读长并行测序 （1）文库指标：valid pairs/unique mapped pairs >65% （2）投标单位自2018年以来（以合同签订时间为准）同类项目大于100；其相关成果发表在Nature、Cell等知名期刊；以上传的文章发表证明文件为准，且作者包含投标人单位信息； （3）投标单位自2020-2021年间曾有在Nature、Cell等知名期刊发文，以上传的文章发表证明文件为准，且文章中（实验方法/致谢）有投标人单位信息； （4）项目周期自招标完成后35个自然日内交付项目结题报告； 项目建设内容： 对斑马鱼的组织样品进行高通量染色体构像捕获（Hi-C），采用T7测序平台（PE150模式）完成DNA互作信息采集。每个样品构建2个Hi-C文库，每个Hi-C文库测序200Gb，即每个样本的总测序量为400Gb Raw data。分辨率至少达到10 kb，然后进行如下分析： （一）数据质控比对、互作矩阵构建 （二）Compartment结构分析 （三）Topologically associated domain (TAD) 结构分析 （四）显著互作位点分析（Loops）； （五）FIRE(Frequently Interacting Regions)检测； （六）样本间互作差异分析； （七）与ATAC、RNA联合分析及个性化挖掘

武汉菲沙基因信息有限公

138000.00